Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LRP1Q07954 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms