Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms