Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4BQ07343 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms