Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SOX4Q06945 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms