Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms