Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms