Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms