Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms