Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FAM3AP98173 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FAM3AP98173 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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