Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms