Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms