Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHBDL3P58872 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHBDL3P58872 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms