Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GJA9P57773 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms