Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SUMO3P55854 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms