Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB3P54284 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms