Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TERF1P54274 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TERF1P54274 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TERF1P54274 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TERF1P54274 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TERF1P54274 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms