Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRE11P49959 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRE11P49959 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRE11P49959 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRE11P49959 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRE11P49959 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms