Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRPC1P48995 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRPC1P48995 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms