Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ME1P48163 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ME1P48163 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ME1P48163 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ME1P48163 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms