Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XCR1P46094 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XCR1P46094 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XCR1P46094 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XCR1P46094 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms