Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTGIRP43119 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms