Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR1BP42025 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms