Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSG3P32926 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSG3P32926 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSG3P32926 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSG3P32926 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms