Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3AP31941 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms