Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXA13P31271 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA13P31271 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA13P31271 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms