Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGA1P29973 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGA1P29973 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms