Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KDM5AP29375 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5AP29375 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms