Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GCAP28676 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GCAP28676 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCAP28676 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCAP28676 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms