Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTFRP26992 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTFRP26992 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTFRP26992 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTFRP26992 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms