Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LMO2P25791 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LMO2P25791 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LMO2P25791 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LMO2P25791 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms