Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPREP23469 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPREP23469 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPREP23469 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPREP23469 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPREP23469 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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