Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms