Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA1P15085 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA1P15085 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA1P15085 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA1P15085 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms