Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRA1P14867 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms