Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DOBP13765 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms