Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN1P12814 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms