Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRFP10586 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRFP10586 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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