Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms