Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CBSLP0DN79 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBSLP0DN79 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms