Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms