Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPBP07199 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms