Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DOAP06340 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DOAP06340 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms