Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTBP3O95758 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTBP3O95758 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms