Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE8BO95263 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms