Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM4BO94953 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms