Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNKO75909 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms