Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGA10O75578 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms