Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCO2O43819 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCO2O43819 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms