Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRY3O43610 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms