Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC11O43248 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms